可以看尾巴，雄性鳄龟的尾巴细长、短小，离肛门较远；体型，雄性鳄龟背甲长窄、宽大，而雌性鳄龟腹部平坦且没有内陷。 交配时间，雄性鳄龟在第一次繁殖后会和其它雌龟进行交配，之后雌龟会怀孕生子。
1、观察尾巴
可以从鳄龟的排泄孔来判断出公母，雌性鳄龟的尾巴显得比较粗长、短小，离肛门较近，并且肛门处还存在有血丝，这是一种分布式正常情况。
2、体型
可以通过对雌性鳄龟的身体特征进行简单地分析来判断公母，首先雄性鳄龟的背甲会稍宽、尾根更为短小，离肛门较近，形状呈圆柱形。 雌性鳄龟的背甲略微宽、尾根处不带有凹陷，摸起来比较舒适，并且雄性鳄龟的体型也要稍大一些。
3、交配时间
雌性鳄龟与其它乌龟一样，会将自己藏在松散的环境中，当雌性荷尔蒙旺盛时，会主动爬向雌龟，期间往往伴随着少量的异性荷尔蒙。 此外，雌性荷尔蒙旺盛时会持续3～6个月左右，如果雌性荷尔蒙浓度高，就说明雄性荷尔蒙旺盛，而雌性荷尔蒙含水量过低则说明雌性荷尔蒙较差，需调整饮食。
尾巴，可轻轻拉扯鳄龟后腿部位，看出是否有咬合力；腹甲形状，用手拉动鳄龟四肢时，会明显感觉到它的回缩，生长一般2年后就能知道原因。 发情期时公鳄龟交配频繁，也可听到叫唤，产卵前雌龟会上来给公鳄龟喂食。
1、尾巴
分辨鳄龟的公母可以观察它们的尾巴和泄殖孔来判断，一般来说，雄性鳄龟的尾巴比雌性更粗壮、更为短小。 从泄殖孔来看，距离肛门较远的位置稍微宽度在20厘米左右，而雌性鳄龟则相对狭窄一些。
2、腹甲形状
从腹甲形态上来看，雄鳄的腹甲向内凹陷，呈平面状，雌鳄的腹甲略向外鼓，带有一定弧度，摸起来十分扁平。 并且腹甲的花纹也大多与胸鳍类似，但雌鳄的腹甲没有明显锯齿形，靠近尾部锐角三个方形。
3、发情期
从泄殖孔来区分还可以听闻鳄龟会在每年5～8月进行交配，这种交配季节在4～9月，雌鳄和雄鳄同居，交配完成后雌鳄会爬入盆中去寻找下口，将其吃掉。
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